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プロフィール

所属

東京工業大学 情報理工学院 情報工学系 助教
東京工業大学 科学技術創成研究院 スマート創薬研究ユニット 兼担

Link: 東京工業大学 情報理工学院 情報工学系 秋山研究室, 東京工業大学 科学技術創成研究院 スマート創薬研究ユニット

経歴

  • 2002.4 石川工業高等専門学校 電子情報工学科 入学
  • 2007.3 石川工業高等専門学校 電子情報工学科 首席卒業
  • 2007.4 東京工業大学 工学部 情報工学科 3年次編入学
  • 2009.3 東京工業大学 工学部 情報工学科 卒業
  • 2009.4 東京工業大学 大学院情報理工学研究科 計算工学専攻 修士課程 入学
  • 2011.3 東京工業大学 大学院情報理工学研究科 計算工学専攻 修士課程 修了
  • 2014.3 東京工業大学 大学院情報理工学研究科 計算工学専攻 博士後期課程 修了,博士(工学)
  • 2011.4-2014.3 日本学術振興会 特別研究員 DC1
  • 2014.4-2015.3 日本学術振興会 特別研究員 PD
  • 2014.4-2015.3 東京工業大学 特別研究員
  • 2015.4-2016.3 東京工業大学 大学院情報理工学研究科 計算工学専攻 助教
  • 2016.4- 東京工業大学 情報理工学院 情報工学系 助教(学内改組による所属変更)
  • 2016.4- 東京工業大学 科学技術創成研究院 スマート創薬研究ユニット 兼担

学会委員等

  • 情報処理学会バイオ情報学研究会運営委員(2017年〜現在)
  • 情報処理学会論文誌TBIO編集委員(2015年〜現在)
  • 日本生物物理学会 理事(2015年〜現在)
  • 日本生物物理学会 代議員(2015年〜2017年)
  • 一般財団法人バイオインダストリー協会 機関誌トピックス委員(2017年〜現在)
  • IPAB IT創薬コンテスト運営委員(2016年〜現在)
  • PRIB2014 Program Committee Member
  • GIW2015 PC Member

論文誌査読

  • Bioinformatics
  • BMC Bioinformatics
  • npj Genetic Medicine
  • Journal of Computational Chemistry
  • SLAS Discovery
  • Molecular Informatics
  • Protein and Peptide Letters
  • IPSJ Transactions on Bioinformatics
  • International Journal of Data Mining and Bioinformatics

学内委員等

  • 東京工業大学 地球史資料館 運営委員(2016年〜現在)

所属学会・研究会

興味

  • バイオインフォマティクス (Bioinformatics and Computational Biology)
    • タンパク質間相互作用(Protein-Protein Interaction)
    • 生物物理学 (Biophysics)
    • 構造生物学 (Structural Biology)
    • システム生物学 (Systems Biology)
  • ケモインフォマティクス (Chemoinformatics)
    • バーチャルスクリーニング (Virtual Screening)
    • タンパク質-リガンド相互作用 (Protein-Ligand Interaction)
  • 機械学習 (Machine Learning)

競争的研究資金 獲得履歴

科研費

  • 日本学術振興会 科研費 若手研究(B),「中規模ペプチドの構造的相互作用解析基盤技術の開発」,2015年4月-2018年3月,代表.
  • 日本学術振興会 科研費 基盤研究(C),「アミノ酸残基レベルの相互作用プロファイルを用いたタンパク質間相互作用予測法の開発」,2015年4月-2018年3月,分担.
  • 日本学術振興会 科研費 特別研究員奨励費,「タンパク質間相互作用予測に基づく創薬ターゲット探索のための並列計算システム開発」,2014年4月-2015年3月,代表.
  • 日本学術振興会 科研費 特別研究員奨励費,「立体構造情報に基づいた網羅的タンパク質間相互作用予測システムの開発」,2011年4月-2014年3月,代表.

その他

  • 日本学術振興会-フランス外務省 二国間交流事業 共同研究 SAKURAプログラム, 2017年4月-2019年3月, 代表. (2,000千円)
  • JSTリサーチコンプレックス事業, 「世界に誇る社会システムと技術の革新で新産業を創るWellbeing Research Campus “Tonomachi”」, 分担.
  • 東京工業大学 「研究の種発掘」支援, 「階層性を持つ生命データ解析のための転移学習法の開発」, 2016年8月-2017年7月, 代表. (500千円)
  • 東京工業大学 情報理工学院若手研究プロジェクト支援, 「クラウド環境上の並列生命情報解析:いつでもどこでもPPI予測」, 2016年9月-2017年3月, 代表. (500千円)
  • 株式会社リバネス 第30回リバネス研究費 マイクロソフト賞, 「ヒトタンパク質の相互作用ネットワークを 網羅的に予測し活用するクラウドシステム開発」, 2016年8月-2017年7月,代表. (500千円)

趣味?

吹奏楽,サクソフォンアンサンブル,編曲,麻雀,音楽ゲーム

保有資格,技能など

  • 第1種普通自動車免許(現中型)
  • 初級システムアドミニストレータ
  • 基本情報技術者
  • ソフトウェア開発技術者
  • JSBi認定バイオインフォマティクス技術者
  • ディジタル技術検定1級情報部門 (文部科学大臣奨励賞受賞)
  • ディジタル技術検定2級制御部門
  • ヤマハエレクトーン演奏グレード6級
  • 絶対音感保持

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Last-modified: 2017-07-31 (月) 00:19:03 (53d)