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プロフィール

所属

東京工業大学 情報理工学院 情報工学系 テニュアトラック助教

Link: 東京工業大学 情報理工学院 情報工学系 大上研究室

経歴

  • 2002.4 石川工業高等専門学校 電子情報工学科 入学
  • 2007.3 石川工業高等専門学校 電子情報工学科 首席卒業
  • 2007.4 東京工業大学 工学部 情報工学科 3年次編入学
  • 2009.3 東京工業大学 工学部 情報工学科 卒業
  • 2009.4 東京工業大学 大学院情報理工学研究科 計算工学専攻 修士課程 入学
  • 2011.3 東京工業大学 大学院情報理工学研究科 計算工学専攻 修士課程 修了
  • 2014.3 東京工業大学 大学院情報理工学研究科 計算工学専攻 博士後期課程 修了,博士(工学) (工博第6564号、東京工業大学)
  • 2011.4-2014.3 日本学術振興会 特別研究員 DC1
  • 2014.4-2015.3 日本学術振興会 特別研究員 PD
  • 2014.4-2015.3 東京工業大学 特別研究員
  • 2015.4-2016.3 東京工業大学 大学院情報理工学研究科 計算工学専攻 助教
  • 2016.4-2020.3 東京工業大学 情報理工学院 情報工学系 助教(学内改組による所属変更)
  • 2016.4-2020.3 東京工業大学 科学技術創成研究院 スマート創薬研究ユニット 兼担
  • 2020.4- 東京工業大学 情報理工学院 情報工学系 テニュアトラック助教

学会委員等

  • 文部科学省 科学技術・学術政策研究所 科学技術予測センター 専門調査員(2017年〜現在)
  • 一般社団法人 日本生物物理学会 理事(2015年〜現在)
  • 一般社団法人 日本生物物理学会 代議員(2015年〜2017年、2019年〜現在)
  • 一般社団法人 日本生物物理学会 男女共同参画・若手支援委員(2015年〜現在)
  • 一般社団法人 日本生物物理学会 分野別専門委員(2019年〜現在)
  • 一般社団法人 情報処理学会バイオ情報学研究会 運営委員(2017年〜現在)
  • 一般社団法人 情報処理学会数理モデル化と問題解決研究会 幹事(2020年〜現在)
  • 一般社団法人 情報処理学会数理モデル化と問題解決研究会 運営委員(2019年〜2020年)
  • 一般社団法人 情報処理学会論文誌Bioinformatics 編集委員会 編集委員(2015年〜2019年)、副委員長(2019年〜現在)
  • 一般財団法人 バイオインダストリー協会 機関誌トピックス委員(2017年〜2020年)
  • 特定非営利活動法人 日本バイオインフォマティクス学会 理事(2020年〜現在)
  • 特定非営利活動法人 日本バイオインフォマティクス学会 幹事(2020年〜現在)
  • 特定非営利活動法人 並列生物情報処理イニシアティブ 理事(2019年〜現在)
  • 特定非営利活動法人 並列生物情報処理イニシアティブ 運営委員(2019年〜現在)
  • 特定非営利活動法人 並列生物情報処理イニシアティブ IT創薬コンテスト運営委員(2016年〜現在)
  • PC Member等
    • Mathematical Modeling and Problem Solving Satellite Workshop of The 26th Int'l Conf on Parallel and Distributed Processing Techniques and Applications (PDPTA'20) PC Member
    • AHeDD2019/IPAB2019 Joint Symposium Local Organizing Committee Chair
    • GIW2018 Program Committee Member
    • IIBMP2018 プログラム委員
    • GIW2015 Program Committee Member
    • PRIB2014 Program Committee Member
  • Journal Paper Reviewer
    • PeerJ
    • npj Genomic Medicine
    • SLAS Discovery
    • Journal of Computational Chemistry
    • Bioinformatics
    • BMC Bioinformatics
    • BMC Genomics
    • BMC Systems Biology
    • BMC Medical Genomics
    • Molecular Informatics
    • IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics
    • IEEE Access
    • Computational Biology and Chemistry
    • Bioscience Reports
    • IPSJ Transactions on Bioinformatics
    • International Journal of Data Mining and Bioinformatics
    • Protein and Peptide Letters
    • Frontiers in Robotics and AI
    • IEICE Transactions on Information and Systems (D)

教育

講義担当

  • 東京工業大学 工学部 情報工学科「情報実験第一」(2015)
  • 東京工業大学 情報理工学院 情報工学系「手続き型プログラミング基礎」(2016〜2019)
  • 東京工業大学 情報理工学院 情報工学系 知能情報コース「知能情報フォーラム」(2016〜2019)
  • 東京工業大学 情報理工学院 情報工学系「手続き型プログラミング発展」(2020)

非常勤講師

  • 東京医科歯科大学 データ関連⼈材育成プログラム 医療・創薬 データサイエンスコンソーシアム 「AI創薬特論」(2019)

学内委員等

  • 東京工業大学 地球史資料館 運営委員(2016年〜2018年)
  • 東京工業大学 情報理工学院 アドミッション委員(2020年〜)

所属学会・研究会

興味

  • バイオインフォマティクス (Bioinformatics and Computational Biology)
    • タンパク質間相互作用(Protein-Protein Interaction)
    • 生物物理学 (Biophysics)
    • 構造生物学 (Structural Biology)
    • システム生物学 (Systems Biology)
  • ケモインフォマティクス (Chemoinformatics)
    • バーチャルスクリーニング (Virtual Screening)
    • タンパク質-リガンドドッキング (Protein-Ligand Docking)
    • タンパク質-リガンド相互作用 (Protein-Ligand Interaction)
  • 機械学習 (Machine Learning)

趣味?

吹奏楽,サクソフォンアンサンブル,編曲,麻雀,音楽ゲーム

保有資格,技能など

  • 第1種普通自動車免許(現中型)
  • 初級システムアドミニストレータ
  • 基本情報技術者
  • ソフトウェア開発技術者
  • JSBi認定バイオインフォマティクス技術者
  • ディジタル技術検定1級情報部門 (文部科学大臣奨励賞受賞)
  • ディジタル技術検定2級制御部門
  • ヤマハエレクトーン演奏グレード6級
  • 絶対音感保持

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Last-modified: 2020-04-02 (木) 18:56:29 (123d)