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プロフィール †
所属 †
東京工業大学 情報理工学院 情報工学系 テニュアトラック助教
Link: 東京工業大学 情報理工学院 情報工学系 大上研究室
経歴 †
- 2002.4 石川工業高等専門学校 電子情報工学科 入学
- 2007.3 石川工業高等専門学校 電子情報工学科 首席卒業
- 2007.4 東京工業大学 工学部 情報工学科 3年次編入学
- 2009.3 東京工業大学 工学部 情報工学科 卒業
- 2009.4 東京工業大学 大学院情報理工学研究科 計算工学専攻 修士課程 入学
- 2011.3 東京工業大学 大学院情報理工学研究科 計算工学専攻 修士課程 修了
- 2014.3 東京工業大学 大学院情報理工学研究科 計算工学専攻 博士後期課程 修了,博士(工学) (工博第6564号、東京工業大学)
- 2011.4-2014.3 日本学術振興会 特別研究員 DC1
- 2014.4-2015.3 日本学術振興会 特別研究員 PD
- 2014.4-2015.3 東京工業大学 特別研究員
- 2015.4-2016.3 東京工業大学 大学院情報理工学研究科 計算工学専攻 助教
- 2016.4-2020.3 東京工業大学 情報理工学院 情報工学系 助教(学内改組による所属変更)
- 2016.4-2020.3 東京工業大学 科学技術創成研究院 スマート創薬研究ユニット 兼担
- 2020.4- 東京工業大学 情報理工学院 情報工学系 テニュアトラック助教
学会委員等 †
- 文部科学省 科学技術・学術政策研究所 科学技術予測センター 専門調査員(2017年〜現在)
- 一般社団法人 日本生物物理学会 理事(2015年〜現在)
- 一般社団法人 日本生物物理学会 代議員(2015年〜2017年、2019年〜現在)
- 一般社団法人 日本生物物理学会 男女共同参画・若手支援委員(2015年〜現在)
- 一般社団法人 日本生物物理学会 分野別専門委員(2019年〜現在)
- 一般社団法人 情報処理学会バイオ情報学研究会 運営委員(2017年〜現在)
- 一般社団法人 情報処理学会数理モデル化と問題解決研究会 幹事(2020年〜現在)
- 一般社団法人 情報処理学会数理モデル化と問題解決研究会 運営委員(2019年〜2020年)
- 一般社団法人 情報処理学会論文誌Bioinformatics 編集委員会 編集委員(2015年〜2019年)、副委員長(2019年〜現在)
- 一般財団法人 バイオインダストリー協会 機関誌トピックス委員(2017年〜2020年)
- 特定非営利活動法人 日本バイオインフォマティクス学会 理事(2020年〜現在)
- 特定非営利活動法人 日本バイオインフォマティクス学会 幹事(2020年〜現在)
- 特定非営利活動法人 並列生物情報処理イニシアティブ 理事(2019年〜現在)
- 特定非営利活動法人 並列生物情報処理イニシアティブ 運営委員(2019年〜現在)
- 特定非営利活動法人 並列生物情報処理イニシアティブ IT創薬コンテスト運営委員(2016年〜現在)
- PC Member等
- Mathematical Modeling and Problem Solving Satellite Workshop of The 26th Int'l Conf on Parallel and Distributed Processing Techniques and Applications (PDPTA'20) PC Member
- AHeDD2019/IPAB2019 Joint Symposium Local Organizing Committee Chair
- GIW2018 Program Committee Member
- IIBMP2018 プログラム委員
- GIW2015 Program Committee Member
- PRIB2014 Program Committee Member
- Journal Paper Reviewer
- PeerJ
- npj Genomic Medicine
- SLAS Discovery
- Journal of Computational Chemistry
- Bioinformatics
- BMC Bioinformatics
- BMC Genomics
- BMC Systems Biology
- BMC Medical Genomics
- Molecular Informatics
- IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics
- IEEE Access
- Computational Biology and Chemistry
- Bioscience Reports
- IPSJ Transactions on Bioinformatics
- International Journal of Data Mining and Bioinformatics
- Protein and Peptide Letters
- Frontiers in Robotics and AI
- IEICE Transactions on Information and Systems (D)
教育 †
講義担当
- 東京工業大学 工学部 情報工学科「情報実験第一」(2015)
- 東京工業大学 情報理工学院 情報工学系「手続き型プログラミング基礎」(2016〜2019)
- 東京工業大学 情報理工学院 情報工学系 知能情報コース「知能情報フォーラム」(2016〜2019)
- 東京工業大学 情報理工学院 情報工学系「手続き型プログラミング発展」(2020)
非常勤講師
- 東京医科歯科大学 データ関連⼈材育成プログラム 医療・創薬 データサイエンスコンソーシアム 「AI創薬特論」(2019)
学内委員等 †
- 東京工業大学 地球史資料館 運営委員(2016年〜2018年)
- 東京工業大学 情報理工学院 アドミッション委員(2020年〜)
所属学会・研究会 †
興味 †
- バイオインフォマティクス (Bioinformatics and Computational Biology)
- タンパク質間相互作用(Protein-Protein Interaction)
- 生物物理学 (Biophysics)
- 構造生物学 (Structural Biology)
- システム生物学 (Systems Biology)
- ケモインフォマティクス (Chemoinformatics)
- バーチャルスクリーニング (Virtual Screening)
- タンパク質-リガンドドッキング (Protein-Ligand Docking)
- タンパク質-リガンド相互作用 (Protein-Ligand Interaction)
- 機械学習 (Machine Learning)
吹奏楽,サクソフォンアンサンブル,編曲,麻雀,音楽ゲーム
保有資格,技能など †
- 第1種普通自動車免許(現中型)
- 初級システムアドミニストレータ
- 基本情報技術者
- ソフトウェア開発技術者
- JSBi認定バイオインフォマティクス技術者
- ディジタル技術検定1級情報部門 (文部科学大臣奨励賞受賞)
- ディジタル技術検定2級制御部門
- ヤマハエレクトーン演奏グレード6級
- 絶対音感保持