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プロフィール †
所属 †
東京工業大学 情報理工学院 情報工学系 テニュアトラック助教
（主担当：知能情報コース、副担当：情報工学コース）
Link: 東京工業大学 情報理工学院 情報工学系 大上研究室
経歴 †
- 2002.4 石川工業高等専門学校 電子情報工学科 入学
- 2007.3 石川工業高等専門学校 電子情報工学科 首席卒業
- 2007.4 東京工業大学 工学部 情報工学科 3年次編入学
- 2009.3 東京工業大学 工学部 情報工学科 卒業
- 2009.4 東京工業大学 大学院情報理工学研究科 計算工学専攻 修士課程 入学
- 2011.3 東京工業大学 大学院情報理工学研究科 計算工学専攻 修士課程 修了
- 2014.3 東京工業大学 大学院情報理工学研究科 計算工学専攻 博士後期課程 修了，博士（工学） （工博第6564号、東京工業大学）
- 2011.4-2014.3 日本学術振興会 特別研究員 DC1
- 2014.4-2015.3 日本学術振興会 特別研究員 PD
- 2014.4-2015.3 東京工業大学 特別研究員
- 2015.4-2016.3 東京工業大学 大学院情報理工学研究科 計算工学専攻 助教
- 2016.4-2020.3 東京工業大学 情報理工学院 情報工学系 助教（学内改組による所属変更）
- 2016.4-2020.3 東京工業大学 科学技術創成研究院 スマート創薬研究ユニット 兼担
- 2020.4- 東京工業大学 情報理工学院 情報工学系 テニュアトラック助教
学会委員等 †
- 文部科学省 科学技術・学術政策研究所 科学技術予測センター 専門調査員（2017年〜現在）
- 一般社団法人 日本生物物理学会 理事（2015年〜2021年）
- 一般社団法人 日本生物物理学会 代議員（2015年〜2017年、2019年〜2021年）
- 一般社団法人 日本生物物理学会 男女共同参画・若手支援委員（2015年〜2021年）
- 一般社団法人 日本生物物理学会 分野別専門委員（2019年〜現在）
- 一般社団法人 情報処理学会バイオ情報学研究会 運営委員（2017年〜2021年）
- 一般社団法人 情報処理学会数理モデル化と問題解決研究会 幹事（2020年〜現在）
- 一般社団法人 情報処理学会数理モデル化と問題解決研究会 運営委員（2019年〜2020年）
- 一般社団法人 情報処理学会論文誌Bioinformatics 編集委員会 編集委員（2015年〜2019年）、副委員長（2019年〜現在）
- 一般社団法人 情報処理学会論文誌数理モデル化と応用 編集委員（2022年〜現在）
- 一般財団法人 バイオインダストリー協会 機関誌トピックス委員（2017年〜2020年）
- 特定非営利活動法人 日本バイオインフォマティクス学会 理事（2020年〜現在）
- 特定非営利活動法人 日本バイオインフォマティクス学会 幹事（2020年〜現在）
- 特定非営利活動法人 並列生物情報処理イニシアティブ 理事（2019年〜現在）
- 特定非営利活動法人 並列生物情報処理イニシアティブ 運営委員（2019年〜現在）
- 特定非営利活動法人 並列生物情報処理イニシアティブ IT創薬コンテスト運営委員（2016年〜現在）
- PC Member等
- Mathematical Modeling and Problem Solving Satellite Workshop of The 28th Int'l Conf on Parallel and Distributed Processing Techniques and Applications (PDPTA'22) Workshop chair
- Mathematical Modeling and Problem Solving Satellite Workshop of The 27th Int'l Conf on Parallel and Distributed Processing Techniques and Applications (PDPTA'21) Workshop chair
- Mathematical Modeling and Problem Solving Satellite Workshop of The 26th Int'l Conf on Parallel and Distributed Processing Techniques and Applications (PDPTA'20) PC Member
- AHeDD2019/IPAB2019 Joint Symposium Local Organizing Committee Chair
- GIW2018 Program Committee Member
- IIBMP2018 プログラム委員
- GIW2015 Program Committee Member
- PRIB2014 Program Committee Member
- Journal Editor
- Frontiers in Molecular Biosciences
- Journal Reviewer
- PeerJ
- npj Genomic Medicine
- SLAS Discovery
- Journal of Computational Chemistry
- Bioinformatics
- BMC Bioinformatics
- BMC Genomics
- BMC Systems Biology
- BMC Medical Genomics
- Molecular Informatics
- IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics
- IEEE Access
- Computational Biology and Chemistry
- Bioscience Reports
- IPSJ Transactions on Bioinformatics
- International Journal of Data Mining and Bioinformatics
- Protein and Peptide Letters
- Frontiers in Robotics and AI
- Frontiers in Molecular Biosciences
- IEICE Transactions on Information and Systems (D)
教育 †
講義担当
- 東京工業大学 工学部 情報工学科「情報実験第一」(2015)
- 東京工業大学 情報理工学院 情報工学系「手続き型プログラミング基礎」(2016〜2019)
- 東京工業大学 情報理工学院 情報工学系 知能情報コース「知能情報フォーラム」(2016〜2019)
- 東京工業大学 情報理工学院 情報工学系「手続き型プログラミング発展」(2020〜)
- 東京工業大学 情報理工学院 情報工学系「Medical and Health Informatics」(2022〜)
- 東京工業大学 情報理工学院「情報理工学リテラシー」（オムニバス形式）(2022)
非常勤講師
- 東京医科歯科大学 データ関連⼈材育成プログラム 医療・創薬 データサイエンスコンソーシアム 「AI創薬特論」(2019)
学内委員等 †
- 東京工業大学 地球史資料館 運営委員（2016〜2018）
- 東京工業大学 情報理工学院 情報工学系 知能情報コース アドミッション委員（2020〜）
- 東京工業大学 学院等安全衛生委員会（2021〜）
所属学会・研究会 †
興味 †
- バイオインフォマティクス (Bioinformatics and Computational Biology)
- タンパク質間相互作用（Protein-Protein Interaction）
- 生物物理学 (Biophysics)
- 構造生物学 (Structural Biology)
- システム生物学 (Systems Biology)
- ケモインフォマティクス (Chemoinformatics)
- バーチャルスクリーニング (Virtual Screening)
- タンパク質-リガンドドッキング (Protein-Ligand Docking)
- タンパク質-リガンド相互作用 (Protein-Ligand Interaction)
- 機械学習 (Machine Learning)
吹奏楽，サクソフォンアンサンブル，編曲，麻雀，音楽ゲーム
保有資格，技能など †
- 第１種普通自動車免許（現中型）
- 初級システムアドミニストレータ
- 基本情報技術者
- ソフトウェア開発技術者
- JSBi認定バイオインフォマティクス技術者
- ディジタル技術検定1級情報部門 （文部科学大臣奨励賞受賞）
- ディジタル技術検定2級制御部門
- ヤマハエレクトーン演奏グレード6級
- 絶対音感保持
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