PyMOL の変更点

追加された行はこの色です。
削除された行はこの色です。
PyMOL へ行く。
PyMOL の差分を削除
#author("2021-07-21T03:24:06+00:00","default:ohue","ohue")
#author("2021-07-21T03:25:38+00:00","default:ohue","ohue")
[[研究メモ]]

**便利なリンク [#wc53346d]
-http://www-cryst.bioc.cam.ac.uk/members/zbyszek/figures_pymol
-http://www.iam.u-tokyo.ac.jp/chem/IMCB-8ken-HP/Lab_Manuals/entori/2010/7/23_PyMOL_(PDB_viewer)_manyuaru.html
-http://d.hatena.ne.jp/biochem_fan/20130717/1374037184

**コピペ用 [#kd2603e5]
 set cartoon_oval_length, 0.9
 set cartoon_oval_width, 0.2
 set cartoon_rect_length, 0.7
 set cartoon_rect_width, 0.3
 set cartoon_loop_radius, 0.15
 set antialias, 3
 set ambient, .2
 set ray_trace_gain, 0
 set ray_trace_mode, 1
 set ray_trace_color, black
 bg_color white
 set opaque_background, 1
 ray

**絵描き [#uc76dc63]
https://gyazo.com/b15b8575275cb6b1d74f883c6f902cd8 (1IGT)
 as spheres
 set ray_trace_gain, 0
 set ray_trace_mode, 3
 set ambient, .4
 set ray_trace_color, black
 set antialias, 3
 ray

**cartoonを細く [#oa2cdd12]
 set cartoon_oval_length, 0.6
 set cartoon_oval_width, 0.15
 set cartoon_rect_length, 0.6
 set cartoon_rect_width, 0.25
 set cartoon_loop_radius, 0.15

**コマンド [#i48d25ee]
pdbidのchain XをHOGEという名前で選ぶ
 select HOGE, (pdbid and chain X)

chain Xの430-440残基を選ぶ
 select HOGE, (resi 430:440 and chain X)

透過png
 set opaque_background, 0

白背景
 bg_color white

ラベルのサイズ
 set label_size, 20

ラベルの色
 set label_color, red

ラベルの縁取り
 set label_outline_color, black